Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms