Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms