Protein–RNA interactions for Protein: Q00994

BEX3, Protein BEX3, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEX3Q00994 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BEX3Q00994 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BEX3Q00994 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BEX3Q00994 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BEX3Q00994 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BEX3Q00994 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BEX3Q00994 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BEX3Q00994 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BEX3Q00994 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BEX3Q00994 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BEX3Q00994 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BEX3Q00994 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BEX3Q00994 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BEX3Q00994 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BEX3Q00994 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BEX3Q00994 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BEX3Q00994 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BEX3Q00994 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BEX3Q00994 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BEX3Q00994 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
BEX3Q00994 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BEX3Q00994 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
BEX3Q00994 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BEX3Q00994 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BEX3Q00994 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BEX3Q00994 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BEX3Q00994 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BEX3Q00994 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BEX3Q00994 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
BEX3Q00994 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BEX3Q00994 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
BEX3Q00994 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
BEX3Q00994 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BEX3Q00994 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms