Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms