Protein–RNA interactions for Protein: P78347

GTF2I, General transcription factor II-I, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IP78347 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2IP78347 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2IP78347 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2IP78347 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2IP78347 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2IP78347 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2IP78347 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2IP78347 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2IP78347 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2IP78347 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2IP78347 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2IP78347 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2IP78347 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2IP78347 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2IP78347 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2IP78347 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2IP78347 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF2IP78347 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF2IP78347 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF2IP78347 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF2IP78347 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF2IP78347 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF2IP78347 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF2IP78347 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF2IP78347 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF2IP78347 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF2IP78347 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF2IP78347 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF2IP78347 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF2IP78347 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF2IP78347 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF2IP78347 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF2IP78347 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF2IP78347 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2IP78347 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2IP78347 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2IP78347 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2IP78347 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2IP78347 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2IP78347 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2IP78347 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2IP78347 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2IP78347 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2IP78347 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2IP78347 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2IP78347 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2IP78347 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2IP78347 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2IP78347 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2IP78347 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2IP78347 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2IP78347 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2IP78347 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2IP78347 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2IP78347 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF2IP78347 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF2IP78347 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF2IP78347 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF2IP78347 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF2IP78347 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF2IP78347 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF2IP78347 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF2IP78347 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF2IP78347 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF2IP78347 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF2IP78347 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF2IP78347 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF2IP78347 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF2IP78347 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF2IP78347 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GTF2IP78347 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GTF2IP78347 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GTF2IP78347 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GTF2IP78347 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GTF2IP78347 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GTF2IP78347 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GTF2IP78347 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GTF2IP78347 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GTF2IP78347 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GTF2IP78347 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GTF2IP78347 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
GTF2IP78347 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GTF2IP78347 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GTF2IP78347 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GTF2IP78347 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GTF2IP78347 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GTF2IP78347 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
GTF2IP78347 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GTF2IP78347 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
GTF2IP78347 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GTF2IP78347 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GTF2IP78347 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
GTF2IP78347 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
GTF2IP78347 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF2IP78347 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF2IP78347 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF2IP78347 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF2IP78347 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF2IP78347 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF2IP78347 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms