Protein–RNA interactions for Protein: P63261

ACTG1, Actin, cytoplasmic 2, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTG1P63261 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTG1P63261 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTG1P63261 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTG1P63261 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTG1P63261 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTG1P63261 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTG1P63261 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTG1P63261 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTG1P63261 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTG1P63261 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTG1P63261 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTG1P63261 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTG1P63261 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTG1P63261 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTG1P63261 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTG1P63261 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTG1P63261 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTG1P63261 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTG1P63261 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTG1P63261 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTG1P63261 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTG1P63261 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTG1P63261 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTG1P63261 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTG1P63261 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTG1P63261 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTG1P63261 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTG1P63261 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTG1P63261 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTG1P63261 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTG1P63261 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTG1P63261 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTG1P63261 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTG1P63261 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTG1P63261 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTG1P63261 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTG1P63261 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTG1P63261 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTG1P63261 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTG1P63261 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTG1P63261 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTG1P63261 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTG1P63261 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTG1P63261 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTG1P63261 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTG1P63261 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTG1P63261 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTG1P63261 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTG1P63261 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTG1P63261 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTG1P63261 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTG1P63261 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTG1P63261 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTG1P63261 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTG1P63261 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTG1P63261 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTG1P63261 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTG1P63261 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTG1P63261 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTG1P63261 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTG1P63261 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTG1P63261 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTG1P63261 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTG1P63261 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTG1P63261 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTG1P63261 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTG1P63261 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTG1P63261 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTG1P63261 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTG1P63261 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTG1P63261 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTG1P63261 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTG1P63261 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTG1P63261 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTG1P63261 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTG1P63261 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTG1P63261 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTG1P63261 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTG1P63261 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTG1P63261 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTG1P63261 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTG1P63261 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTG1P63261 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTG1P63261 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTG1P63261 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTG1P63261 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTG1P63261 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTG1P63261 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTG1P63261 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTG1P63261 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTG1P63261 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTG1P63261 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTG1P63261 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTG1P63261 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTG1P63261 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTG1P63261 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTG1P63261 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTG1P63261 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTG1P63261 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTG1P63261 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms