Protein–RNA interactions for Protein: P61568

ERVK11-1, Putative endogenous retrovirus group K member 11-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK11-1P61568 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms