Protein–RNA interactions for Protein: P60520

GABARAPL2, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL2P60520 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABARAPL2P60520 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABARAPL2P60520 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABARAPL2P60520 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABARAPL2P60520 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABARAPL2P60520 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABARAPL2P60520 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABARAPL2P60520 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABARAPL2P60520 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABARAPL2P60520 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABARAPL2P60520 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GABARAPL2P60520 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABARAPL2P60520 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABARAPL2P60520 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABARAPL2P60520 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABARAPL2P60520 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABARAPL2P60520 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABARAPL2P60520 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABARAPL2P60520 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABARAPL2P60520 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABARAPL2P60520 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABARAPL2P60520 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABARAPL2P60520 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABARAPL2P60520 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GABARAPL2P60520 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABARAPL2P60520 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GABARAPL2P60520 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABARAPL2P60520 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABARAPL2P60520 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABARAPL2P60520 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABARAPL2P60520 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABARAPL2P60520 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABARAPL2P60520 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABARAPL2P60520 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABARAPL2P60520 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABARAPL2P60520 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABARAPL2P60520 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GABARAPL2P60520 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABARAPL2P60520 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABARAPL2P60520 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABARAPL2P60520 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABARAPL2P60520 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABARAPL2P60520 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABARAPL2P60520 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABARAPL2P60520 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABARAPL2P60520 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABARAPL2P60520 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABARAPL2P60520 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GABARAPL2P60520 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABARAPL2P60520 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABARAPL2P60520 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABARAPL2P60520 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABARAPL2P60520 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABARAPL2P60520 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABARAPL2P60520 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABARAPL2P60520 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABARAPL2P60520 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABARAPL2P60520 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABARAPL2P60520 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABARAPL2P60520 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABARAPL2P60520 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABARAPL2P60520 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABARAPL2P60520 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABARAPL2P60520 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABARAPL2P60520 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABARAPL2P60520 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABARAPL2P60520 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABARAPL2P60520 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABARAPL2P60520 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABARAPL2P60520 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABARAPL2P60520 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABARAPL2P60520 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABARAPL2P60520 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABARAPL2P60520 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABARAPL2P60520 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABARAPL2P60520 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABARAPL2P60520 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABARAPL2P60520 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABARAPL2P60520 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABARAPL2P60520 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABARAPL2P60520 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABARAPL2P60520 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABARAPL2P60520 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABARAPL2P60520 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABARAPL2P60520 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABARAPL2P60520 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABARAPL2P60520 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABARAPL2P60520 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABARAPL2P60520 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABARAPL2P60520 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABARAPL2P60520 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABARAPL2P60520 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABARAPL2P60520 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABARAPL2P60520 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABARAPL2P60520 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABARAPL2P60520 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABARAPL2P60520 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABARAPL2P60520 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABARAPL2P60520 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABARAPL2P60520 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms