Protein–RNA interactions for Protein: P59894

DCDC1, Doublecortin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCDC1P59894 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms