Protein–RNA interactions for Protein: P57796

CABP4, Calcium-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP4P57796 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CABP4P57796 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CABP4P57796 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CABP4P57796 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CABP4P57796 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CABP4P57796 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CABP4P57796 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CABP4P57796 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CABP4P57796 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CABP4P57796 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CABP4P57796 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CABP4P57796 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CABP4P57796 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CABP4P57796 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CABP4P57796 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CABP4P57796 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CABP4P57796 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CABP4P57796 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CABP4P57796 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CABP4P57796 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CABP4P57796 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CABP4P57796 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CABP4P57796 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CABP4P57796 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CABP4P57796 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CABP4P57796 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CABP4P57796 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CABP4P57796 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CABP4P57796 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CABP4P57796 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CABP4P57796 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CABP4P57796 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CABP4P57796 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CABP4P57796 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CABP4P57796 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CABP4P57796 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CABP4P57796 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CABP4P57796 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CABP4P57796 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CABP4P57796 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CABP4P57796 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CABP4P57796 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CABP4P57796 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CABP4P57796 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CABP4P57796 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CABP4P57796 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CABP4P57796 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CABP4P57796 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CABP4P57796 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CABP4P57796 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CABP4P57796 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CABP4P57796 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CABP4P57796 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CABP4P57796 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CABP4P57796 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CABP4P57796 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CABP4P57796 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CABP4P57796 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CABP4P57796 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CABP4P57796 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CABP4P57796 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CABP4P57796 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CABP4P57796 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CABP4P57796 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CABP4P57796 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CABP4P57796 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CABP4P57796 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CABP4P57796 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CABP4P57796 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CABP4P57796 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CABP4P57796 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CABP4P57796 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CABP4P57796 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CABP4P57796 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CABP4P57796 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CABP4P57796 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CABP4P57796 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CABP4P57796 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CABP4P57796 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CABP4P57796 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CABP4P57796 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CABP4P57796 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CABP4P57796 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CABP4P57796 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CABP4P57796 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CABP4P57796 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CABP4P57796 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CABP4P57796 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CABP4P57796 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CABP4P57796 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CABP4P57796 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CABP4P57796 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CABP4P57796 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CABP4P57796 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CABP4P57796 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CABP4P57796 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CABP4P57796 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CABP4P57796 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CABP4P57796 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CABP4P57796 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms