Protein–RNA interactions for Protein: P57735

RAB25, Ras-related protein Rab-25, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB25P57735 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB25P57735 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB25P57735 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB25P57735 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB25P57735 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB25P57735 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB25P57735 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB25P57735 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB25P57735 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB25P57735 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB25P57735 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB25P57735 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB25P57735 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB25P57735 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB25P57735 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB25P57735 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB25P57735 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB25P57735 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB25P57735 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB25P57735 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB25P57735 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB25P57735 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB25P57735 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB25P57735 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB25P57735 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB25P57735 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB25P57735 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB25P57735 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB25P57735 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB25P57735 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB25P57735 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB25P57735 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB25P57735 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB25P57735 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB25P57735 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB25P57735 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB25P57735 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB25P57735 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB25P57735 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB25P57735 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB25P57735 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB25P57735 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB25P57735 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB25P57735 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB25P57735 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB25P57735 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB25P57735 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB25P57735 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB25P57735 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB25P57735 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB25P57735 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB25P57735 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB25P57735 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB25P57735 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB25P57735 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB25P57735 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB25P57735 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB25P57735 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB25P57735 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB25P57735 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB25P57735 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB25P57735 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB25P57735 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB25P57735 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB25P57735 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB25P57735 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB25P57735 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB25P57735 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB25P57735 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB25P57735 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB25P57735 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB25P57735 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB25P57735 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB25P57735 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB25P57735 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB25P57735 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB25P57735 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB25P57735 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB25P57735 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB25P57735 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB25P57735 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB25P57735 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB25P57735 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB25P57735 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB25P57735 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB25P57735 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB25P57735 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB25P57735 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB25P57735 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB25P57735 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB25P57735 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB25P57735 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB25P57735 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB25P57735 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB25P57735 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB25P57735 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB25P57735 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB25P57735 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB25P57735 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB25P57735 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms