Protein–RNA interactions for Protein: P57053

H2BFS, Histone H2B type F-S, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2BFSP57053 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2BFSP57053 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2BFSP57053 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2BFSP57053 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
H2BFSP57053 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
H2BFSP57053 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
H2BFSP57053 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.08■□□□□ 0
H2BFSP57053 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
H2BFSP57053 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC15.08■□□□□ 0
H2BFSP57053 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
H2BFSP57053 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
H2BFSP57053 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2BFSP57053 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC15.08■□□□□ 0
H2BFSP57053 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2BFSP57053 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
H2BFSP57053 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
H2BFSP57053 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
H2BFSP57053 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2BFSP57053 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
H2BFSP57053 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2BFSP57053 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
H2BFSP57053 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2BFSP57053 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2BFSP57053 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
H2BFSP57053 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC15.08■□□□□ 0
H2BFSP57053 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
H2BFSP57053 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
H2BFSP57053 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2BFSP57053 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2BFSP57053 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
H2BFSP57053 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2BFSP57053 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2BFSP57053 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2BFSP57053 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2BFSP57053 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2BFSP57053 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
H2BFSP57053 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2BFSP57053 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2BFSP57053 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2BFSP57053 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2BFSP57053 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
H2BFSP57053 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
H2BFSP57053 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2BFSP57053 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
H2BFSP57053 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
H2BFSP57053 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2BFSP57053 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2BFSP57053 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
H2BFSP57053 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2BFSP57053 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
H2BFSP57053 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2BFSP57053 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2BFSP57053 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
H2BFSP57053 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
H2BFSP57053 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC15.07■□□□□ 0
H2BFSP57053 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
H2BFSP57053 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2BFSP57053 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
H2BFSP57053 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
H2BFSP57053 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
H2BFSP57053 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC15.07■□□□□ 0
H2BFSP57053 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
H2BFSP57053 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
H2BFSP57053 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC15.07■□□□□ 0
H2BFSP57053 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
H2BFSP57053 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
H2BFSP57053 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC15.07■□□□□ 0
H2BFSP57053 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
H2BFSP57053 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
H2BFSP57053 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
H2BFSP57053 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
H2BFSP57053 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2BFSP57053 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
H2BFSP57053 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2BFSP57053 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2BFSP57053 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
H2BFSP57053 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
H2BFSP57053 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms