Protein–RNA interactions for Protein: P49642

PRIM1, DNA primase small subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIM1P49642 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRIM1P49642 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms