Protein–RNA interactions for Protein: P49458

SRP9, Signal recognition particle 9 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP9P49458 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRP9P49458 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRP9P49458 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRP9P49458 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRP9P49458 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRP9P49458 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRP9P49458 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRP9P49458 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRP9P49458 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRP9P49458 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRP9P49458 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRP9P49458 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRP9P49458 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRP9P49458 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SRP9P49458 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRP9P49458 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRP9P49458 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRP9P49458 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRP9P49458 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRP9P49458 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRP9P49458 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRP9P49458 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRP9P49458 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRP9P49458 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRP9P49458 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRP9P49458 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRP9P49458 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRP9P49458 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRP9P49458 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRP9P49458 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRP9P49458 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRP9P49458 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRP9P49458 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRP9P49458 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SRP9P49458 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRP9P49458 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SRP9P49458 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRP9P49458 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRP9P49458 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRP9P49458 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRP9P49458 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRP9P49458 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRP9P49458 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRP9P49458 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRP9P49458 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRP9P49458 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRP9P49458 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRP9P49458 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRP9P49458 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRP9P49458 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRP9P49458 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRP9P49458 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRP9P49458 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRP9P49458 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRP9P49458 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRP9P49458 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRP9P49458 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SRP9P49458 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRP9P49458 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRP9P49458 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRP9P49458 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRP9P49458 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRP9P49458 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRP9P49458 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRP9P49458 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRP9P49458 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SRP9P49458 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRP9P49458 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRP9P49458 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRP9P49458 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRP9P49458 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRP9P49458 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SRP9P49458 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRP9P49458 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRP9P49458 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SRP9P49458 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SRP9P49458 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SRP9P49458 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRP9P49458 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRP9P49458 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRP9P49458 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRP9P49458 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRP9P49458 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRP9P49458 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRP9P49458 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRP9P49458 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRP9P49458 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRP9P49458 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRP9P49458 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRP9P49458 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRP9P49458 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRP9P49458 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRP9P49458 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRP9P49458 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRP9P49458 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRP9P49458 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRP9P49458 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRP9P49458 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRP9P49458 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRP9P49458 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms