Protein–RNA interactions for Protein: P43354

NR4A2, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A2P43354 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms