Protein–RNA interactions for Protein: P43005

SLC1A1, Excitatory amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A1P43005 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC1A1P43005 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SLC1A1P43005 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SLC1A1P43005 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SLC1A1P43005 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SLC1A1P43005 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SLC1A1P43005 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SLC1A1P43005 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SLC1A1P43005 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms