Protein–RNA interactions for Protein: P42262

GRIA2, Glutamate receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA2P42262 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms