Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMPOP42166 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMPOP42166 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMPOP42166 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMPOP42166 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMPOP42166 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMPOP42166 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMPOP42166 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMPOP42166 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMPOP42166 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMPOP42166 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMPOP42166 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMPOP42166 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMPOP42166 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMPOP42166 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMPOP42166 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMPOP42166 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMPOP42166 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMPOP42166 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMPOP42166 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMPOP42166 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMPOP42166 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMPOP42166 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TMPOP42166 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMPOP42166 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMPOP42166 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMPOP42166 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMPOP42166 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMPOP42166 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TMPOP42166 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMPOP42166 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TMPOP42166 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMPOP42166 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TMPOP42166 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMPOP42166 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMPOP42166 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMPOP42166 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMPOP42166 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMPOP42166 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMPOP42166 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMPOP42166 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMPOP42166 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMPOP42166 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMPOP42166 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMPOP42166 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMPOP42166 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMPOP42166 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMPOP42166 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TMPOP42166 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMPOP42166 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMPOP42166 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMPOP42166 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMPOP42166 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMPOP42166 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMPOP42166 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMPOP42166 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMPOP42166 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMPOP42166 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMPOP42166 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMPOP42166 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMPOP42166 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMPOP42166 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMPOP42166 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMPOP42166 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMPOP42166 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMPOP42166 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMPOP42166 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMPOP42166 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMPOP42166 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMPOP42166 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMPOP42166 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMPOP42166 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMPOP42166 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMPOP42166 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMPOP42166 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMPOP42166 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMPOP42166 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TMPOP42166 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMPOP42166 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMPOP42166 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMPOP42166 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TMPOP42166 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMPOP42166 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMPOP42166 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMPOP42166 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMPOP42166 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMPOP42166 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMPOP42166 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMPOP42166 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMPOP42166 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMPOP42166 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMPOP42166 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMPOP42166 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMPOP42166 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMPOP42166 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMPOP42166 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TMPOP42166 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TMPOP42166 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TMPOP42166 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMPOP42166 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms