Protein–RNA interactions for Protein: P35499

SCN4A, Sodium channel protein type 4 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,836 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN4AP35499 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCN4AP35499 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCN4AP35499 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCN4AP35499 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCN4AP35499 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCN4AP35499 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SCN4AP35499 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCN4AP35499 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCN4AP35499 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCN4AP35499 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCN4AP35499 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCN4AP35499 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCN4AP35499 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCN4AP35499 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCN4AP35499 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCN4AP35499 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCN4AP35499 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCN4AP35499 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCN4AP35499 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCN4AP35499 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCN4AP35499 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCN4AP35499 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCN4AP35499 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCN4AP35499 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCN4AP35499 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCN4AP35499 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCN4AP35499 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCN4AP35499 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SCN4AP35499 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCN4AP35499 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SCN4AP35499 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCN4AP35499 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCN4AP35499 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCN4AP35499 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCN4AP35499 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SCN4AP35499 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCN4AP35499 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SCN4AP35499 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SCN4AP35499 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCN4AP35499 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCN4AP35499 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCN4AP35499 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCN4AP35499 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCN4AP35499 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCN4AP35499 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCN4AP35499 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCN4AP35499 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCN4AP35499 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCN4AP35499 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCN4AP35499 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCN4AP35499 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCN4AP35499 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCN4AP35499 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SCN4AP35499 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SCN4AP35499 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCN4AP35499 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCN4AP35499 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCN4AP35499 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCN4AP35499 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCN4AP35499 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCN4AP35499 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCN4AP35499 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCN4AP35499 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCN4AP35499 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCN4AP35499 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCN4AP35499 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCN4AP35499 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCN4AP35499 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCN4AP35499 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SCN4AP35499 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SCN4AP35499 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SCN4AP35499 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SCN4AP35499 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCN4AP35499 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SCN4AP35499 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCN4AP35499 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCN4AP35499 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCN4AP35499 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCN4AP35499 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCN4AP35499 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SCN4AP35499 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SCN4AP35499 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SCN4AP35499 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SCN4AP35499 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SCN4AP35499 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SCN4AP35499 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
SCN4AP35499 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
SCN4AP35499 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SCN4AP35499 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SCN4AP35499 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
SCN4AP35499 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SCN4AP35499 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCN4AP35499 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCN4AP35499 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SCN4AP35499 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCN4AP35499 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCN4AP35499 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCN4AP35499 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCN4AP35499 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCN4AP35499 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
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