Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJA4P35212 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJA4P35212 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJA4P35212 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJA4P35212 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJA4P35212 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJA4P35212 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJA4P35212 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJA4P35212 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJA4P35212 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJA4P35212 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJA4P35212 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJA4P35212 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GJA4P35212 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GJA4P35212 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJA4P35212 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJA4P35212 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJA4P35212 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJA4P35212 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJA4P35212 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJA4P35212 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJA4P35212 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJA4P35212 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJA4P35212 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJA4P35212 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJA4P35212 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJA4P35212 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJA4P35212 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJA4P35212 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJA4P35212 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJA4P35212 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJA4P35212 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJA4P35212 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJA4P35212 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJA4P35212 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJA4P35212 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJA4P35212 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJA4P35212 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJA4P35212 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJA4P35212 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GJA4P35212 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJA4P35212 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJA4P35212 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJA4P35212 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJA4P35212 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJA4P35212 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJA4P35212 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJA4P35212 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJA4P35212 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJA4P35212 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJA4P35212 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJA4P35212 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJA4P35212 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GJA4P35212 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJA4P35212 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJA4P35212 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJA4P35212 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJA4P35212 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJA4P35212 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJA4P35212 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJA4P35212 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJA4P35212 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJA4P35212 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJA4P35212 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJA4P35212 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJA4P35212 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJA4P35212 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJA4P35212 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJA4P35212 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJA4P35212 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJA4P35212 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJA4P35212 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJA4P35212 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GJA4P35212 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJA4P35212 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJA4P35212 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJA4P35212 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJA4P35212 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GJA4P35212 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJA4P35212 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GJA4P35212 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJA4P35212 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJA4P35212 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GJA4P35212 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJA4P35212 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJA4P35212 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GJA4P35212 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJA4P35212 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJA4P35212 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJA4P35212 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJA4P35212 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJA4P35212 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJA4P35212 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJA4P35212 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJA4P35212 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJA4P35212 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GJA4P35212 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GJA4P35212 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GJA4P35212 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GJA4P35212 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms