Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GPC1P35052 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPC1P35052 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPC1P35052 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPC1P35052 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPC1P35052 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GPC1P35052 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GPC1P35052 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPC1P35052 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPC1P35052 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPC1P35052 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPC1P35052 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPC1P35052 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPC1P35052 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPC1P35052 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPC1P35052 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPC1P35052 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPC1P35052 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPC1P35052 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPC1P35052 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPC1P35052 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPC1P35052 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GPC1P35052 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPC1P35052 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPC1P35052 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPC1P35052 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPC1P35052 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPC1P35052 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPC1P35052 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPC1P35052 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPC1P35052 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPC1P35052 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPC1P35052 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPC1P35052 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GPC1P35052 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GPC1P35052 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPC1P35052 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPC1P35052 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPC1P35052 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPC1P35052 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GPC1P35052 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPC1P35052 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPC1P35052 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPC1P35052 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPC1P35052 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPC1P35052 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPC1P35052 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPC1P35052 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPC1P35052 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GPC1P35052 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPC1P35052 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPC1P35052 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GPC1P35052 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPC1P35052 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPC1P35052 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GPC1P35052 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPC1P35052 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPC1P35052 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPC1P35052 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPC1P35052 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPC1P35052 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPC1P35052 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPC1P35052 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPC1P35052 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPC1P35052 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPC1P35052 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPC1P35052 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPC1P35052 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPC1P35052 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPC1P35052 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GPC1P35052 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPC1P35052 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GPC1P35052 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPC1P35052 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPC1P35052 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GPC1P35052 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPC1P35052 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GPC1P35052 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPC1P35052 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GPC1P35052 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPC1P35052 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPC1P35052 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPC1P35052 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPC1P35052 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPC1P35052 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPC1P35052 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPC1P35052 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPC1P35052 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPC1P35052 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GPC1P35052 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GPC1P35052 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GPC1P35052 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GPC1P35052 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
GPC1P35052 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
GPC1P35052 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GPC1P35052 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GPC1P35052 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GPC1P35052 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GPC1P35052 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GPC1P35052 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms