Protein–RNA interactions for Protein: P31941

APOBEC3A, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3AP31941 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms