Protein–RNA interactions for Protein: P29353

SHC1, SHC-transforming protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHC1P29353 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SHC1P29353 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SHC1P29353 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SHC1P29353 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SHC1P29353 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SHC1P29353 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SHC1P29353 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SHC1P29353 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SHC1P29353 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SHC1P29353 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SHC1P29353 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SHC1P29353 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SHC1P29353 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SHC1P29353 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SHC1P29353 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SHC1P29353 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SHC1P29353 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SHC1P29353 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SHC1P29353 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SHC1P29353 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SHC1P29353 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SHC1P29353 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SHC1P29353 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SHC1P29353 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SHC1P29353 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SHC1P29353 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SHC1P29353 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SHC1P29353 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SHC1P29353 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SHC1P29353 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SHC1P29353 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SHC1P29353 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SHC1P29353 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SHC1P29353 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SHC1P29353 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SHC1P29353 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SHC1P29353 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SHC1P29353 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SHC1P29353 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SHC1P29353 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SHC1P29353 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SHC1P29353 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SHC1P29353 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SHC1P29353 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SHC1P29353 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SHC1P29353 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SHC1P29353 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SHC1P29353 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SHC1P29353 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SHC1P29353 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SHC1P29353 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SHC1P29353 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SHC1P29353 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SHC1P29353 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SHC1P29353 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SHC1P29353 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SHC1P29353 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SHC1P29353 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SHC1P29353 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SHC1P29353 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SHC1P29353 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SHC1P29353 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SHC1P29353 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SHC1P29353 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SHC1P29353 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SHC1P29353 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SHC1P29353 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SHC1P29353 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SHC1P29353 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SHC1P29353 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SHC1P29353 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SHC1P29353 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SHC1P29353 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SHC1P29353 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SHC1P29353 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SHC1P29353 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SHC1P29353 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SHC1P29353 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SHC1P29353 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SHC1P29353 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SHC1P29353 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SHC1P29353 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SHC1P29353 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SHC1P29353 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SHC1P29353 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SHC1P29353 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SHC1P29353 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SHC1P29353 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SHC1P29353 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SHC1P29353 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SHC1P29353 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SHC1P29353 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SHC1P29353 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SHC1P29353 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SHC1P29353 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SHC1P29353 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SHC1P29353 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SHC1P29353 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SHC1P29353 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SHC1P29353 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms