Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGA6P23229 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGA6P23229 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGA6P23229 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGA6P23229 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGA6P23229 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGA6P23229 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGA6P23229 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGA6P23229 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGA6P23229 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGA6P23229 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGA6P23229 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGA6P23229 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGA6P23229 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGA6P23229 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGA6P23229 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGA6P23229 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGA6P23229 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGA6P23229 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGA6P23229 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGA6P23229 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGA6P23229 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGA6P23229 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGA6P23229 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGA6P23229 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGA6P23229 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGA6P23229 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGA6P23229 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGA6P23229 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGA6P23229 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGA6P23229 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGA6P23229 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGA6P23229 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGA6P23229 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGA6P23229 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGA6P23229 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGA6P23229 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGA6P23229 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGA6P23229 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGA6P23229 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGA6P23229 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGA6P23229 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGA6P23229 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGA6P23229 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGA6P23229 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGA6P23229 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGA6P23229 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGA6P23229 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGA6P23229 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGA6P23229 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGA6P23229 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGA6P23229 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGA6P23229 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGA6P23229 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGA6P23229 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGA6P23229 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGA6P23229 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGA6P23229 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGA6P23229 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGA6P23229 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGA6P23229 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGA6P23229 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGA6P23229 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGA6P23229 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGA6P23229 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGA6P23229 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGA6P23229 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGA6P23229 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGA6P23229 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGA6P23229 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGA6P23229 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGA6P23229 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGA6P23229 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGA6P23229 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGA6P23229 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGA6P23229 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGA6P23229 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGA6P23229 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGA6P23229 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGA6P23229 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGA6P23229 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGA6P23229 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGA6P23229 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGA6P23229 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGA6P23229 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGA6P23229 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGA6P23229 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGA6P23229 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGA6P23229 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGA6P23229 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGA6P23229 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGA6P23229 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGA6P23229 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGA6P23229 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGA6P23229 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGA6P23229 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGA6P23229 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGA6P23229 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGA6P23229 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGA6P23229 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms