Protein–RNA interactions for Protein: P23025

XPA, DNA repair protein complementing XP-A cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPAP23025 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
XPAP23025 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
XPAP23025 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
XPAP23025 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
XPAP23025 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
XPAP23025 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
XPAP23025 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
XPAP23025 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
XPAP23025 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
XPAP23025 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
XPAP23025 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
XPAP23025 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
XPAP23025 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
XPAP23025 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
XPAP23025 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
XPAP23025 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
XPAP23025 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
XPAP23025 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
XPAP23025 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
XPAP23025 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
XPAP23025 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
XPAP23025 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
XPAP23025 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
XPAP23025 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
XPAP23025 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
XPAP23025 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
XPAP23025 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
XPAP23025 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
XPAP23025 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
XPAP23025 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
XPAP23025 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
XPAP23025 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
XPAP23025 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
XPAP23025 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
XPAP23025 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
XPAP23025 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
XPAP23025 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
XPAP23025 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
XPAP23025 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
XPAP23025 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
XPAP23025 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
XPAP23025 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
XPAP23025 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
XPAP23025 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
XPAP23025 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
XPAP23025 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
XPAP23025 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
XPAP23025 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
XPAP23025 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
XPAP23025 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
XPAP23025 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
XPAP23025 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
XPAP23025 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
XPAP23025 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
XPAP23025 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
XPAP23025 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
XPAP23025 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
XPAP23025 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
XPAP23025 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
XPAP23025 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
XPAP23025 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
XPAP23025 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
XPAP23025 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
XPAP23025 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
XPAP23025 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
XPAP23025 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
XPAP23025 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
XPAP23025 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
XPAP23025 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
XPAP23025 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
XPAP23025 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
XPAP23025 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
XPAP23025 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
XPAP23025 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
XPAP23025 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
XPAP23025 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
XPAP23025 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
XPAP23025 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
XPAP23025 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
XPAP23025 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
XPAP23025 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
XPAP23025 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
XPAP23025 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
XPAP23025 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
XPAP23025 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
XPAP23025 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
XPAP23025 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
XPAP23025 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
XPAP23025 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
XPAP23025 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
XPAP23025 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
XPAP23025 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
XPAP23025 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
XPAP23025 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
XPAP23025 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
XPAP23025 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
XPAP23025 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
XPAP23025 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
XPAP23025 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
XPAP23025 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms