Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD247P20963 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CD247P20963 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD247P20963 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD247P20963 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD247P20963 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD247P20963 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD247P20963 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD247P20963 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD247P20963 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD247P20963 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD247P20963 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD247P20963 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD247P20963 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD247P20963 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD247P20963 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD247P20963 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD247P20963 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD247P20963 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD247P20963 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD247P20963 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD247P20963 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD247P20963 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD247P20963 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD247P20963 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD247P20963 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CD247P20963 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD247P20963 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD247P20963 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD247P20963 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD247P20963 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD247P20963 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD247P20963 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD247P20963 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD247P20963 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD247P20963 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD247P20963 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD247P20963 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD247P20963 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD247P20963 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD247P20963 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD247P20963 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD247P20963 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CD247P20963 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD247P20963 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD247P20963 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD247P20963 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD247P20963 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD247P20963 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD247P20963 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD247P20963 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD247P20963 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD247P20963 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD247P20963 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD247P20963 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD247P20963 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD247P20963 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD247P20963 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD247P20963 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD247P20963 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD247P20963 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD247P20963 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD247P20963 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD247P20963 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD247P20963 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD247P20963 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD247P20963 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD247P20963 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD247P20963 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD247P20963 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD247P20963 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD247P20963 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD247P20963 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD247P20963 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD247P20963 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD247P20963 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD247P20963 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD247P20963 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD247P20963 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD247P20963 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD247P20963 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD247P20963 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CD247P20963 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD247P20963 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD247P20963 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CD247P20963 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD247P20963 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD247P20963 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CD247P20963 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD247P20963 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD247P20963 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD247P20963 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD247P20963 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD247P20963 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD247P20963 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD247P20963 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD247P20963 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD247P20963 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD247P20963 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD247P20963 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms