Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRHP20396 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRHP20396 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRHP20396 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRHP20396 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRHP20396 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRHP20396 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRHP20396 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRHP20396 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRHP20396 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRHP20396 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
TRHP20396 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRHP20396 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
TRHP20396 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRHP20396 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRHP20396 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRHP20396 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRHP20396 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRHP20396 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRHP20396 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRHP20396 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRHP20396 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
TRHP20396 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRHP20396 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRHP20396 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
TRHP20396 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRHP20396 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRHP20396 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRHP20396 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
TRHP20396 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRHP20396 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRHP20396 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRHP20396 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRHP20396 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRHP20396 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRHP20396 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRHP20396 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRHP20396 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
TRHP20396 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRHP20396 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRHP20396 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRHP20396 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
TRHP20396 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRHP20396 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRHP20396 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRHP20396 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRHP20396 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRHP20396 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRHP20396 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRHP20396 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRHP20396 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRHP20396 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRHP20396 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
TRHP20396 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
TRHP20396 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRHP20396 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRHP20396 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRHP20396 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
TRHP20396 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
TRHP20396 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
TRHP20396 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
TRHP20396 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
TRHP20396 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
TRHP20396 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
TRHP20396 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRHP20396 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRHP20396 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRHP20396 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRHP20396 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRHP20396 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRHP20396 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
TRHP20396 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRHP20396 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRHP20396 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRHP20396 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRHP20396 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRHP20396 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRHP20396 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRHP20396 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRHP20396 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRHP20396 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRHP20396 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRHP20396 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRHP20396 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
TRHP20396 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRHP20396 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRHP20396 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRHP20396 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRHP20396 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRHP20396 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRHP20396 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
TRHP20396 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRHP20396 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRHP20396 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRHP20396 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRHP20396 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRHP20396 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRHP20396 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRHP20396 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRHP20396 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms