Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CCNA2P20248 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCNA2P20248 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCNA2P20248 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCNA2P20248 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCNA2P20248 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCNA2P20248 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCNA2P20248 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCNA2P20248 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCNA2P20248 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCNA2P20248 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCNA2P20248 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCNA2P20248 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCNA2P20248 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCNA2P20248 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCNA2P20248 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCNA2P20248 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCNA2P20248 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCNA2P20248 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCNA2P20248 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCNA2P20248 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCNA2P20248 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CCNA2P20248 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CCNA2P20248 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCNA2P20248 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCNA2P20248 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCNA2P20248 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCNA2P20248 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CCNA2P20248 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCNA2P20248 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CCNA2P20248 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCNA2P20248 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCNA2P20248 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCNA2P20248 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCNA2P20248 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCNA2P20248 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms