Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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