Protein–RNA interactions for Protein: P17483

HOXB4, Homeobox protein Hox-B4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB4P17483 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms