Protein–RNA interactions for Protein: P14867

GABRA1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA1P14867 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms