Protein–RNA interactions for Protein: P11836

MS4A1, B-lymphocyte antigen CD20, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A1P11836 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MS4A1P11836 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MS4A1P11836 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MS4A1P11836 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MS4A1P11836 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MS4A1P11836 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MS4A1P11836 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MS4A1P11836 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
MS4A1P11836 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MS4A1P11836 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MS4A1P11836 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MS4A1P11836 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MS4A1P11836 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MS4A1P11836 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MS4A1P11836 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MS4A1P11836 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MS4A1P11836 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MS4A1P11836 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MS4A1P11836 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MS4A1P11836 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MS4A1P11836 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MS4A1P11836 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MS4A1P11836 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MS4A1P11836 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MS4A1P11836 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MS4A1P11836 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MS4A1P11836 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MS4A1P11836 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MS4A1P11836 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MS4A1P11836 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MS4A1P11836 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MS4A1P11836 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MS4A1P11836 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
MS4A1P11836 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MS4A1P11836 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
MS4A1P11836 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MS4A1P11836 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms