Protein–RNA interactions for Protein: P11488

GNAT1, Guanine nucleotide-binding protein G(t) subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNAT1P11488 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GNAT1P11488 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GNAT1P11488 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GNAT1P11488 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GNAT1P11488 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GNAT1P11488 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GNAT1P11488 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GNAT1P11488 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GNAT1P11488 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GNAT1P11488 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GNAT1P11488 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GNAT1P11488 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GNAT1P11488 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GNAT1P11488 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GNAT1P11488 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GNAT1P11488 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GNAT1P11488 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GNAT1P11488 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GNAT1P11488 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GNAT1P11488 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GNAT1P11488 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GNAT1P11488 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GNAT1P11488 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GNAT1P11488 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GNAT1P11488 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GNAT1P11488 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GNAT1P11488 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GNAT1P11488 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GNAT1P11488 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GNAT1P11488 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GNAT1P11488 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GNAT1P11488 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GNAT1P11488 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GNAT1P11488 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GNAT1P11488 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GNAT1P11488 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GNAT1P11488 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GNAT1P11488 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GNAT1P11488 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GNAT1P11488 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GNAT1P11488 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GNAT1P11488 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GNAT1P11488 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GNAT1P11488 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GNAT1P11488 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GNAT1P11488 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GNAT1P11488 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GNAT1P11488 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GNAT1P11488 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GNAT1P11488 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GNAT1P11488 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GNAT1P11488 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GNAT1P11488 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GNAT1P11488 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GNAT1P11488 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GNAT1P11488 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GNAT1P11488 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GNAT1P11488 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GNAT1P11488 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GNAT1P11488 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GNAT1P11488 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GNAT1P11488 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GNAT1P11488 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GNAT1P11488 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GNAT1P11488 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GNAT1P11488 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GNAT1P11488 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GNAT1P11488 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GNAT1P11488 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GNAT1P11488 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GNAT1P11488 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GNAT1P11488 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GNAT1P11488 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GNAT1P11488 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GNAT1P11488 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GNAT1P11488 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GNAT1P11488 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GNAT1P11488 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GNAT1P11488 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GNAT1P11488 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GNAT1P11488 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GNAT1P11488 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GNAT1P11488 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GNAT1P11488 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GNAT1P11488 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GNAT1P11488 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GNAT1P11488 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GNAT1P11488 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GNAT1P11488 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GNAT1P11488 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GNAT1P11488 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GNAT1P11488 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GNAT1P11488 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GNAT1P11488 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GNAT1P11488 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GNAT1P11488 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GNAT1P11488 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GNAT1P11488 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GNAT1P11488 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GNAT1P11488 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms