Protein–RNA interactions for Protein: P10072

HKR1, Krueppel-related zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKR1P10072 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HKR1P10072 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HKR1P10072 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HKR1P10072 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HKR1P10072 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HKR1P10072 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HKR1P10072 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HKR1P10072 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HKR1P10072 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HKR1P10072 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HKR1P10072 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HKR1P10072 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HKR1P10072 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HKR1P10072 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HKR1P10072 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HKR1P10072 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HKR1P10072 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HKR1P10072 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HKR1P10072 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HKR1P10072 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HKR1P10072 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HKR1P10072 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HKR1P10072 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HKR1P10072 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HKR1P10072 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HKR1P10072 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HKR1P10072 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HKR1P10072 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HKR1P10072 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HKR1P10072 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HKR1P10072 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HKR1P10072 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HKR1P10072 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HKR1P10072 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HKR1P10072 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HKR1P10072 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HKR1P10072 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HKR1P10072 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HKR1P10072 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HKR1P10072 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HKR1P10072 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HKR1P10072 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HKR1P10072 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HKR1P10072 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HKR1P10072 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HKR1P10072 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HKR1P10072 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HKR1P10072 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HKR1P10072 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HKR1P10072 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HKR1P10072 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HKR1P10072 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HKR1P10072 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HKR1P10072 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HKR1P10072 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HKR1P10072 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HKR1P10072 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HKR1P10072 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HKR1P10072 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HKR1P10072 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HKR1P10072 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HKR1P10072 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HKR1P10072 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HKR1P10072 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HKR1P10072 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HKR1P10072 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HKR1P10072 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HKR1P10072 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HKR1P10072 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HKR1P10072 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HKR1P10072 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HKR1P10072 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HKR1P10072 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HKR1P10072 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HKR1P10072 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HKR1P10072 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HKR1P10072 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HKR1P10072 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HKR1P10072 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HKR1P10072 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HKR1P10072 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HKR1P10072 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HKR1P10072 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HKR1P10072 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HKR1P10072 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HKR1P10072 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HKR1P10072 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HKR1P10072 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HKR1P10072 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HKR1P10072 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HKR1P10072 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HKR1P10072 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HKR1P10072 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HKR1P10072 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HKR1P10072 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HKR1P10072 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HKR1P10072 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HKR1P10072 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HKR1P10072 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HKR1P10072 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms