Protein–RNA interactions for Protein: P0DP24

CALM2, Calmodulin-2, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALM2P0DP24 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CALM2P0DP24 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CALM2P0DP24 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CALM2P0DP24 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CALM2P0DP24 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CALM2P0DP24 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CALM2P0DP24 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CALM2P0DP24 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CALM2P0DP24 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CALM2P0DP24 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
CALM2P0DP24 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CALM2P0DP24 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CALM2P0DP24 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CALM2P0DP24 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CALM2P0DP24 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CALM2P0DP24 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CALM2P0DP24 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CALM2P0DP24 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CALM2P0DP24 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CALM2P0DP24 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CALM2P0DP24 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CALM2P0DP24 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CALM2P0DP24 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CALM2P0DP24 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CALM2P0DP24 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CALM2P0DP24 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CALM2P0DP24 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CALM2P0DP24 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CALM2P0DP24 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CALM2P0DP24 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CALM2P0DP24 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CALM2P0DP24 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CALM2P0DP24 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CALM2P0DP24 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CALM2P0DP24 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CALM2P0DP24 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CALM2P0DP24 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CALM2P0DP24 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CALM2P0DP24 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CALM2P0DP24 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CALM2P0DP24 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CALM2P0DP24 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CALM2P0DP24 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CALM2P0DP24 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CALM2P0DP24 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CALM2P0DP24 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CALM2P0DP24 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CALM2P0DP24 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CALM2P0DP24 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CALM2P0DP24 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CALM2P0DP24 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CALM2P0DP24 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CALM2P0DP24 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CALM2P0DP24 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CALM2P0DP24 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CALM2P0DP24 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CALM2P0DP24 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CALM2P0DP24 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CALM2P0DP24 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CALM2P0DP24 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CALM2P0DP24 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CALM2P0DP24 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CALM2P0DP24 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CALM2P0DP24 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CALM2P0DP24 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CALM2P0DP24 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CALM2P0DP24 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CALM2P0DP24 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CALM2P0DP24 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CALM2P0DP24 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CALM2P0DP24 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CALM2P0DP24 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CALM2P0DP24 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CALM2P0DP24 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CALM2P0DP24 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CALM2P0DP24 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CALM2P0DP24 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CALM2P0DP24 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CALM2P0DP24 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CALM2P0DP24 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CALM2P0DP24 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CALM2P0DP24 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CALM2P0DP24 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CALM2P0DP24 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CALM2P0DP24 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CALM2P0DP24 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CALM2P0DP24 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CALM2P0DP24 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CALM2P0DP24 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CALM2P0DP24 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CALM2P0DP24 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CALM2P0DP24 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CALM2P0DP24 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CALM2P0DP24 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CALM2P0DP24 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CALM2P0DP24 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CALM2P0DP24 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CALM2P0DP24 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CALM2P0DP24 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CALM2P0DP24 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms