Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC192P0DO97 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC192P0DO97 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC192P0DO97 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC192P0DO97 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC192P0DO97 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC192P0DO97 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC192P0DO97 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC192P0DO97 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC192P0DO97 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC192P0DO97 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC192P0DO97 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC192P0DO97 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC192P0DO97 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC192P0DO97 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC192P0DO97 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC192P0DO97 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC192P0DO97 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC192P0DO97 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC192P0DO97 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC192P0DO97 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC192P0DO97 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC192P0DO97 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC192P0DO97 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC192P0DO97 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC192P0DO97 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC192P0DO97 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC192P0DO97 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC192P0DO97 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CCDC192P0DO97 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CCDC192P0DO97 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CCDC192P0DO97 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CCDC192P0DO97 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CCDC192P0DO97 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC192P0DO97 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC192P0DO97 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC192P0DO97 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC192P0DO97 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC192P0DO97 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC192P0DO97 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC192P0DO97 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC192P0DO97 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC192P0DO97 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC192P0DO97 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC192P0DO97 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC192P0DO97 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC192P0DO97 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC192P0DO97 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC192P0DO97 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC192P0DO97 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC192P0DO97 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC192P0DO97 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC192P0DO97 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC192P0DO97 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC192P0DO97 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC192P0DO97 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC192P0DO97 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC192P0DO97 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC192P0DO97 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC192P0DO97 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC192P0DO97 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC192P0DO97 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC192P0DO97 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC192P0DO97 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC192P0DO97 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC192P0DO97 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC192P0DO97 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC192P0DO97 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC192P0DO97 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC192P0DO97 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC192P0DO97 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC192P0DO97 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC192P0DO97 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC192P0DO97 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC192P0DO97 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC192P0DO97 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC192P0DO97 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC192P0DO97 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC192P0DO97 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC192P0DO97 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC192P0DO97 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC192P0DO97 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC192P0DO97 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC192P0DO97 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC192P0DO97 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC192P0DO97 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC192P0DO97 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC192P0DO97 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC192P0DO97 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC192P0DO97 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC192P0DO97 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC192P0DO97 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC192P0DO97 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC192P0DO97 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC192P0DO97 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC192P0DO97 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC192P0DO97 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC192P0DO97 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC192P0DO97 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC192P0DO97 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms