Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C4BP0C0L5 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C4BP0C0L5 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C4BP0C0L5 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
C4BP0C0L5 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C4BP0C0L5 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C4BP0C0L5 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C4BP0C0L5 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C4BP0C0L5 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
C4BP0C0L5 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C4BP0C0L5 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C4BP0C0L5 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C4BP0C0L5 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C4BP0C0L5 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C4BP0C0L5 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C4BP0C0L5 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C4BP0C0L5 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C4BP0C0L5 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
C4BP0C0L5 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C4BP0C0L5 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C4BP0C0L5 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C4BP0C0L5 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C4BP0C0L5 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C4BP0C0L5 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
C4BP0C0L5 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C4BP0C0L5 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C4BP0C0L5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C4BP0C0L5 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C4BP0C0L5 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C4BP0C0L5 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
C4BP0C0L5 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C4BP0C0L5 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C4BP0C0L5 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C4BP0C0L5 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C4BP0C0L5 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C4BP0C0L5 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C4BP0C0L5 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C4BP0C0L5 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C4BP0C0L5 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C4BP0C0L5 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C4BP0C0L5 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C4BP0C0L5 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C4BP0C0L5 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C4BP0C0L5 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C4BP0C0L5 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C4BP0C0L5 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C4BP0C0L5 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
C4BP0C0L5 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
C4BP0C0L5 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C4BP0C0L5 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C4BP0C0L5 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C4BP0C0L5 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C4BP0C0L5 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C4BP0C0L5 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C4BP0C0L5 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C4BP0C0L5 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C4BP0C0L5 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C4BP0C0L5 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
C4BP0C0L5 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C4BP0C0L5 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C4BP0C0L5 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
C4BP0C0L5 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C4BP0C0L5 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C4BP0C0L5 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C4BP0C0L5 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
C4BP0C0L5 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C4BP0C0L5 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C4BP0C0L5 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C4BP0C0L5 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
C4BP0C0L5 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C4BP0C0L5 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C4BP0C0L5 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C4BP0C0L5 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C4BP0C0L5 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C4BP0C0L5 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C4BP0C0L5 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C4BP0C0L5 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C4BP0C0L5 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C4BP0C0L5 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C4BP0C0L5 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C4BP0C0L5 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C4BP0C0L5 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
C4BP0C0L5 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C4BP0C0L5 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C4BP0C0L5 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
C4BP0C0L5 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C4BP0C0L5 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C4BP0C0L5 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C4BP0C0L5 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C4BP0C0L5 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C4BP0C0L5 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C4BP0C0L5 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C4BP0C0L5 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C4BP0C0L5 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C4BP0C0L5 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C4BP0C0L5 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C4BP0C0L5 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C4BP0C0L5 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C4BP0C0L5 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
C4BP0C0L5 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
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