Protein–RNA interactions for Protein: P08648

ITGA5, Integrin alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA5P08648 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGA5P08648 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGA5P08648 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGA5P08648 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGA5P08648 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGA5P08648 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGA5P08648 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGA5P08648 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGA5P08648 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGA5P08648 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGA5P08648 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGA5P08648 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGA5P08648 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGA5P08648 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGA5P08648 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGA5P08648 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGA5P08648 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGA5P08648 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGA5P08648 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGA5P08648 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGA5P08648 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGA5P08648 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGA5P08648 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGA5P08648 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGA5P08648 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGA5P08648 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGA5P08648 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGA5P08648 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGA5P08648 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGA5P08648 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGA5P08648 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGA5P08648 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGA5P08648 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGA5P08648 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGA5P08648 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGA5P08648 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGA5P08648 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGA5P08648 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGA5P08648 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGA5P08648 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGA5P08648 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGA5P08648 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGA5P08648 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGA5P08648 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGA5P08648 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGA5P08648 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGA5P08648 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGA5P08648 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGA5P08648 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGA5P08648 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA5P08648 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA5P08648 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA5P08648 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA5P08648 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA5P08648 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA5P08648 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA5P08648 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA5P08648 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA5P08648 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA5P08648 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA5P08648 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA5P08648 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA5P08648 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA5P08648 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA5P08648 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA5P08648 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA5P08648 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA5P08648 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA5P08648 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA5P08648 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA5P08648 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA5P08648 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA5P08648 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA5P08648 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA5P08648 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA5P08648 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA5P08648 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA5P08648 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA5P08648 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA5P08648 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA5P08648 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA5P08648 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA5P08648 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA5P08648 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA5P08648 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA5P08648 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA5P08648 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA5P08648 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA5P08648 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA5P08648 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA5P08648 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA5P08648 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA5P08648 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA5P08648 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA5P08648 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA5P08648 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA5P08648 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA5P08648 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA5P08648 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA5P08648 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms