Protein–RNA interactions for Protein: P07197

NEFM, Neurofilament medium polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFMP07197 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEFMP07197 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NEFMP07197 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEFMP07197 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NEFMP07197 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEFMP07197 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEFMP07197 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEFMP07197 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEFMP07197 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEFMP07197 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEFMP07197 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEFMP07197 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEFMP07197 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEFMP07197 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEFMP07197 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEFMP07197 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEFMP07197 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NEFMP07197 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
NEFMP07197 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEFMP07197 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEFMP07197 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEFMP07197 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEFMP07197 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEFMP07197 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEFMP07197 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEFMP07197 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEFMP07197 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEFMP07197 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEFMP07197 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEFMP07197 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEFMP07197 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEFMP07197 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEFMP07197 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NEFMP07197 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEFMP07197 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEFMP07197 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEFMP07197 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEFMP07197 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEFMP07197 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEFMP07197 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEFMP07197 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEFMP07197 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEFMP07197 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEFMP07197 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEFMP07197 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEFMP07197 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEFMP07197 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEFMP07197 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEFMP07197 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEFMP07197 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEFMP07197 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEFMP07197 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NEFMP07197 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEFMP07197 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEFMP07197 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEFMP07197 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEFMP07197 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEFMP07197 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEFMP07197 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NEFMP07197 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEFMP07197 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEFMP07197 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEFMP07197 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEFMP07197 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEFMP07197 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEFMP07197 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEFMP07197 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEFMP07197 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEFMP07197 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEFMP07197 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEFMP07197 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEFMP07197 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEFMP07197 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEFMP07197 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NEFMP07197 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEFMP07197 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NEFMP07197 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEFMP07197 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEFMP07197 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEFMP07197 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEFMP07197 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEFMP07197 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEFMP07197 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NEFMP07197 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEFMP07197 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEFMP07197 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEFMP07197 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEFMP07197 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEFMP07197 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEFMP07197 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEFMP07197 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEFMP07197 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NEFMP07197 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEFMP07197 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEFMP07197 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEFMP07197 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEFMP07197 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NEFMP07197 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEFMP07197 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEFMP07197 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms