Protein–RNA interactions for Protein: P04280

PRB1, Basic salivary proline-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRB1P04280 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRB1P04280 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRB1P04280 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRB1P04280 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PRB1P04280 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRB1P04280 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRB1P04280 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRB1P04280 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRB1P04280 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRB1P04280 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRB1P04280 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRB1P04280 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRB1P04280 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRB1P04280 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRB1P04280 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRB1P04280 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRB1P04280 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRB1P04280 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRB1P04280 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRB1P04280 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRB1P04280 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRB1P04280 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRB1P04280 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRB1P04280 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRB1P04280 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRB1P04280 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRB1P04280 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRB1P04280 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRB1P04280 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRB1P04280 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRB1P04280 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRB1P04280 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRB1P04280 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRB1P04280 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRB1P04280 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRB1P04280 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRB1P04280 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRB1P04280 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRB1P04280 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRB1P04280 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRB1P04280 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRB1P04280 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRB1P04280 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRB1P04280 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRB1P04280 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRB1P04280 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRB1P04280 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PRB1P04280 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRB1P04280 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRB1P04280 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRB1P04280 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PRB1P04280 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRB1P04280 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRB1P04280 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRB1P04280 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRB1P04280 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRB1P04280 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRB1P04280 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRB1P04280 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRB1P04280 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRB1P04280 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRB1P04280 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRB1P04280 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRB1P04280 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRB1P04280 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRB1P04280 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PRB1P04280 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRB1P04280 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRB1P04280 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRB1P04280 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRB1P04280 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRB1P04280 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRB1P04280 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRB1P04280 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRB1P04280 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PRB1P04280 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRB1P04280 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRB1P04280 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRB1P04280 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRB1P04280 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PRB1P04280 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRB1P04280 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRB1P04280 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRB1P04280 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRB1P04280 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PRB1P04280 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRB1P04280 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRB1P04280 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PRB1P04280 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRB1P04280 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRB1P04280 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRB1P04280 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRB1P04280 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRB1P04280 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRB1P04280 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRB1P04280 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRB1P04280 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRB1P04280 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRB1P04280 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRB1P04280 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms