Protein–RNA interactions for Protein: P02671

FGA, Fibrinogen alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGAP02671 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FGAP02671 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FGAP02671 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FGAP02671 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FGAP02671 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FGAP02671 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FGAP02671 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FGAP02671 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FGAP02671 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FGAP02671 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FGAP02671 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
FGAP02671 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FGAP02671 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
FGAP02671 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FGAP02671 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FGAP02671 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FGAP02671 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FGAP02671 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FGAP02671 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FGAP02671 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FGAP02671 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FGAP02671 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FGAP02671 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FGAP02671 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FGAP02671 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FGAP02671 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FGAP02671 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FGAP02671 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FGAP02671 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FGAP02671 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FGAP02671 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FGAP02671 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FGAP02671 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FGAP02671 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FGAP02671 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FGAP02671 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FGAP02671 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FGAP02671 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
FGAP02671 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
FGAP02671 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
FGAP02671 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
FGAP02671 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FGAP02671 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
FGAP02671 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
FGAP02671 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FGAP02671 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FGAP02671 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FGAP02671 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FGAP02671 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FGAP02671 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FGAP02671 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FGAP02671 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FGAP02671 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FGAP02671 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FGAP02671 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FGAP02671 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FGAP02671 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FGAP02671 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FGAP02671 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FGAP02671 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FGAP02671 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FGAP02671 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FGAP02671 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FGAP02671 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FGAP02671 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FGAP02671 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FGAP02671 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FGAP02671 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FGAP02671 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FGAP02671 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FGAP02671 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FGAP02671 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FGAP02671 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FGAP02671 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FGAP02671 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FGAP02671 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FGAP02671 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FGAP02671 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FGAP02671 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FGAP02671 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FGAP02671 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FGAP02671 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FGAP02671 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FGAP02671 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FGAP02671 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FGAP02671 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FGAP02671 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FGAP02671 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FGAP02671 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FGAP02671 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FGAP02671 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FGAP02671 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FGAP02671 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FGAP02671 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FGAP02671 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FGAP02671 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FGAP02671 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FGAP02671 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FGAP02671 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FGAP02671 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms