Protein–RNA interactions for Protein: P02462

COL4A1, Collagen alpha-1(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A1P02462 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL4A1P02462 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL4A1P02462 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
COL4A1P02462 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL4A1P02462 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL4A1P02462 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL4A1P02462 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL4A1P02462 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL4A1P02462 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL4A1P02462 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL4A1P02462 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL4A1P02462 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL4A1P02462 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL4A1P02462 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL4A1P02462 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL4A1P02462 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL4A1P02462 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL4A1P02462 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL4A1P02462 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
COL4A1P02462 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL4A1P02462 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL4A1P02462 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL4A1P02462 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL4A1P02462 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL4A1P02462 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL4A1P02462 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL4A1P02462 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL4A1P02462 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL4A1P02462 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
COL4A1P02462 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL4A1P02462 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL4A1P02462 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL4A1P02462 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL4A1P02462 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL4A1P02462 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL4A1P02462 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL4A1P02462 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL4A1P02462 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL4A1P02462 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
COL4A1P02462 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL4A1P02462 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL4A1P02462 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL4A1P02462 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL4A1P02462 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL4A1P02462 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL4A1P02462 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL4A1P02462 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL4A1P02462 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL4A1P02462 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL4A1P02462 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL4A1P02462 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL4A1P02462 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL4A1P02462 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL4A1P02462 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL4A1P02462 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL4A1P02462 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL4A1P02462 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL4A1P02462 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL4A1P02462 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL4A1P02462 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL4A1P02462 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL4A1P02462 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL4A1P02462 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
COL4A1P02462 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL4A1P02462 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL4A1P02462 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL4A1P02462 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL4A1P02462 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL4A1P02462 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL4A1P02462 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL4A1P02462 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL4A1P02462 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL4A1P02462 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL4A1P02462 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL4A1P02462 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL4A1P02462 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL4A1P02462 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL4A1P02462 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL4A1P02462 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL4A1P02462 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL4A1P02462 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
COL4A1P02462 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL4A1P02462 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL4A1P02462 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL4A1P02462 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL4A1P02462 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL4A1P02462 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL4A1P02462 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL4A1P02462 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL4A1P02462 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL4A1P02462 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL4A1P02462 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL4A1P02462 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL4A1P02462 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL4A1P02462 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL4A1P02462 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL4A1P02462 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL4A1P02462 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
COL4A1P02462 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
COL4A1P02462 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms