Protein–RNA interactions for Protein: O94874

UFL1, E3 UFM1-protein ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 794 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFL1O94874 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UFL1O94874 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UFL1O94874 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UFL1O94874 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UFL1O94874 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UFL1O94874 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UFL1O94874 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UFL1O94874 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UFL1O94874 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UFL1O94874 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UFL1O94874 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UFL1O94874 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UFL1O94874 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UFL1O94874 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UFL1O94874 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UFL1O94874 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UFL1O94874 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UFL1O94874 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UFL1O94874 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
UFL1O94874 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UFL1O94874 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UFL1O94874 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UFL1O94874 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UFL1O94874 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UFL1O94874 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UFL1O94874 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
UFL1O94874 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
UFL1O94874 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
UFL1O94874 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
UFL1O94874 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
UFL1O94874 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
UFL1O94874 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
UFL1O94874 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
UFL1O94874 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
UFL1O94874 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
UFL1O94874 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
UFL1O94874 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UFL1O94874 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UFL1O94874 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UFL1O94874 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UFL1O94874 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UFL1O94874 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UFL1O94874 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
UFL1O94874 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UFL1O94874 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UFL1O94874 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UFL1O94874 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UFL1O94874 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UFL1O94874 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UFL1O94874 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UFL1O94874 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UFL1O94874 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UFL1O94874 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UFL1O94874 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UFL1O94874 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UFL1O94874 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UFL1O94874 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UFL1O94874 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UFL1O94874 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UFL1O94874 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UFL1O94874 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UFL1O94874 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UFL1O94874 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UFL1O94874 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UFL1O94874 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UFL1O94874 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UFL1O94874 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UFL1O94874 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UFL1O94874 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UFL1O94874 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UFL1O94874 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UFL1O94874 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UFL1O94874 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UFL1O94874 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UFL1O94874 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UFL1O94874 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UFL1O94874 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UFL1O94874 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UFL1O94874 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UFL1O94874 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UFL1O94874 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UFL1O94874 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UFL1O94874 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UFL1O94874 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UFL1O94874 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UFL1O94874 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UFL1O94874 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UFL1O94874 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UFL1O94874 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UFL1O94874 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UFL1O94874 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UFL1O94874 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UFL1O94874 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UFL1O94874 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UFL1O94874 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UFL1O94874 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UFL1O94874 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UFL1O94874 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UFL1O94874 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UFL1O94874 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms