Protein–RNA interactions for Protein: O94817

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG12O94817 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG12O94817 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG12O94817 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG12O94817 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG12O94817 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG12O94817 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG12O94817 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG12O94817 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG12O94817 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG12O94817 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG12O94817 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG12O94817 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG12O94817 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG12O94817 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG12O94817 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG12O94817 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG12O94817 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG12O94817 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG12O94817 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG12O94817 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG12O94817 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG12O94817 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG12O94817 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG12O94817 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG12O94817 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG12O94817 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG12O94817 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG12O94817 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG12O94817 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG12O94817 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG12O94817 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG12O94817 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG12O94817 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG12O94817 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG12O94817 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG12O94817 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG12O94817 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG12O94817 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG12O94817 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG12O94817 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG12O94817 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG12O94817 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG12O94817 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG12O94817 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG12O94817 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG12O94817 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG12O94817 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG12O94817 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG12O94817 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG12O94817 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG12O94817 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG12O94817 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG12O94817 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG12O94817 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG12O94817 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG12O94817 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG12O94817 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG12O94817 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG12O94817 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG12O94817 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG12O94817 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG12O94817 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG12O94817 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG12O94817 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG12O94817 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG12O94817 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG12O94817 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG12O94817 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG12O94817 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG12O94817 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG12O94817 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG12O94817 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG12O94817 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG12O94817 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG12O94817 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG12O94817 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG12O94817 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG12O94817 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG12O94817 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG12O94817 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG12O94817 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG12O94817 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG12O94817 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG12O94817 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG12O94817 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG12O94817 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG12O94817 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG12O94817 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG12O94817 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG12O94817 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG12O94817 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG12O94817 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG12O94817 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG12O94817 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG12O94817 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG12O94817 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG12O94817 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG12O94817 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG12O94817 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG12O94817 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms