Protein–RNA interactions for Protein: O94759

TRPM2, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPM2O94759 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRPM2O94759 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRPM2O94759 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRPM2O94759 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRPM2O94759 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRPM2O94759 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRPM2O94759 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRPM2O94759 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRPM2O94759 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRPM2O94759 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRPM2O94759 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRPM2O94759 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRPM2O94759 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRPM2O94759 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRPM2O94759 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRPM2O94759 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TRPM2O94759 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRPM2O94759 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TRPM2O94759 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRPM2O94759 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRPM2O94759 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRPM2O94759 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRPM2O94759 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRPM2O94759 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRPM2O94759 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRPM2O94759 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRPM2O94759 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
TRPM2O94759 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRPM2O94759 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRPM2O94759 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRPM2O94759 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRPM2O94759 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRPM2O94759 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRPM2O94759 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRPM2O94759 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRPM2O94759 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRPM2O94759 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRPM2O94759 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRPM2O94759 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRPM2O94759 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRPM2O94759 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRPM2O94759 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRPM2O94759 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRPM2O94759 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRPM2O94759 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRPM2O94759 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRPM2O94759 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
TRPM2O94759 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
TRPM2O94759 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRPM2O94759 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRPM2O94759 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRPM2O94759 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRPM2O94759 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
TRPM2O94759 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRPM2O94759 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRPM2O94759 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRPM2O94759 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
TRPM2O94759 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRPM2O94759 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TRPM2O94759 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRPM2O94759 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRPM2O94759 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TRPM2O94759 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TRPM2O94759 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRPM2O94759 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRPM2O94759 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
TRPM2O94759 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TRPM2O94759 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRPM2O94759 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TRPM2O94759 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRPM2O94759 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TRPM2O94759 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRPM2O94759 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRPM2O94759 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRPM2O94759 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TRPM2O94759 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRPM2O94759 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRPM2O94759 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRPM2O94759 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRPM2O94759 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRPM2O94759 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRPM2O94759 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRPM2O94759 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRPM2O94759 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TRPM2O94759 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRPM2O94759 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRPM2O94759 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRPM2O94759 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRPM2O94759 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRPM2O94759 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRPM2O94759 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRPM2O94759 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRPM2O94759 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRPM2O94759 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRPM2O94759 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRPM2O94759 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRPM2O94759 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRPM2O94759 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRPM2O94759 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRPM2O94759 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms