Protein–RNA interactions for Protein: O75936

BBOX1, Gamma-butyrobetaine dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBOX1O75936 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BBOX1O75936 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BBOX1O75936 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BBOX1O75936 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BBOX1O75936 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BBOX1O75936 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BBOX1O75936 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BBOX1O75936 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BBOX1O75936 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BBOX1O75936 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BBOX1O75936 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BBOX1O75936 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
BBOX1O75936 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BBOX1O75936 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BBOX1O75936 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BBOX1O75936 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
BBOX1O75936 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BBOX1O75936 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BBOX1O75936 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
BBOX1O75936 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BBOX1O75936 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BBOX1O75936 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BBOX1O75936 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BBOX1O75936 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BBOX1O75936 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BBOX1O75936 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BBOX1O75936 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BBOX1O75936 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BBOX1O75936 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BBOX1O75936 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BBOX1O75936 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BBOX1O75936 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BBOX1O75936 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BBOX1O75936 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
BBOX1O75936 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BBOX1O75936 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BBOX1O75936 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BBOX1O75936 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BBOX1O75936 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BBOX1O75936 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BBOX1O75936 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BBOX1O75936 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BBOX1O75936 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BBOX1O75936 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BBOX1O75936 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BBOX1O75936 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BBOX1O75936 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BBOX1O75936 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BBOX1O75936 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BBOX1O75936 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BBOX1O75936 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BBOX1O75936 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BBOX1O75936 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BBOX1O75936 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BBOX1O75936 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BBOX1O75936 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BBOX1O75936 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BBOX1O75936 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BBOX1O75936 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BBOX1O75936 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BBOX1O75936 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BBOX1O75936 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BBOX1O75936 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BBOX1O75936 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BBOX1O75936 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BBOX1O75936 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BBOX1O75936 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
BBOX1O75936 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BBOX1O75936 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
BBOX1O75936 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
BBOX1O75936 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
BBOX1O75936 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BBOX1O75936 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
BBOX1O75936 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BBOX1O75936 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BBOX1O75936 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BBOX1O75936 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BBOX1O75936 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BBOX1O75936 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BBOX1O75936 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BBOX1O75936 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
BBOX1O75936 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BBOX1O75936 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BBOX1O75936 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BBOX1O75936 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BBOX1O75936 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BBOX1O75936 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BBOX1O75936 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BBOX1O75936 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BBOX1O75936 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BBOX1O75936 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BBOX1O75936 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BBOX1O75936 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BBOX1O75936 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BBOX1O75936 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BBOX1O75936 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BBOX1O75936 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BBOX1O75936 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BBOX1O75936 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BBOX1O75936 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms