Protein–RNA interactions for Protein: O75920

SERF1A, Small EDRK-rich factor 1, humanhuman

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERF1AO75920 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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