Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms