Protein–RNA interactions for Protein: O60303

KIAA0556, Protein KIAA0556, humanhuman

Predictions only

Length 1,618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0556O60303 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
KIAA0556O60303 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
KIAA0556O60303 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
KIAA0556O60303 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
KIAA0556O60303 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
KIAA0556O60303 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
KIAA0556O60303 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
KIAA0556O60303 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
KIAA0556O60303 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
KIAA0556O60303 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
KIAA0556O60303 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
KIAA0556O60303 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
KIAA0556O60303 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
KIAA0556O60303 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
KIAA0556O60303 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
KIAA0556O60303 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KIAA0556O60303 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
KIAA0556O60303 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
KIAA0556O60303 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
KIAA0556O60303 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
KIAA0556O60303 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
KIAA0556O60303 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
KIAA0556O60303 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
KIAA0556O60303 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KIAA0556O60303 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KIAA0556O60303 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KIAA0556O60303 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
KIAA0556O60303 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KIAA0556O60303 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KIAA0556O60303 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KIAA0556O60303 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KIAA0556O60303 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
KIAA0556O60303 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KIAA0556O60303 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KIAA0556O60303 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KIAA0556O60303 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
KIAA0556O60303 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
KIAA0556O60303 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KIAA0556O60303 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
KIAA0556O60303 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KIAA0556O60303 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KIAA0556O60303 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KIAA0556O60303 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KIAA0556O60303 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
KIAA0556O60303 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KIAA0556O60303 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KIAA0556O60303 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KIAA0556O60303 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
KIAA0556O60303 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
KIAA0556O60303 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
KIAA0556O60303 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
KIAA0556O60303 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
KIAA0556O60303 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KIAA0556O60303 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KIAA0556O60303 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KIAA0556O60303 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KIAA0556O60303 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KIAA0556O60303 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
KIAA0556O60303 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KIAA0556O60303 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KIAA0556O60303 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KIAA0556O60303 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KIAA0556O60303 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
KIAA0556O60303 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
KIAA0556O60303 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
KIAA0556O60303 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
KIAA0556O60303 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
KIAA0556O60303 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KIAA0556O60303 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
KIAA0556O60303 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
KIAA0556O60303 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
KIAA0556O60303 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
KIAA0556O60303 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
KIAA0556O60303 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
KIAA0556O60303 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
KIAA0556O60303 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KIAA0556O60303 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KIAA0556O60303 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KIAA0556O60303 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
KIAA0556O60303 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KIAA0556O60303 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KIAA0556O60303 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
KIAA0556O60303 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
KIAA0556O60303 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KIAA0556O60303 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
KIAA0556O60303 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
KIAA0556O60303 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
KIAA0556O60303 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KIAA0556O60303 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KIAA0556O60303 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
KIAA0556O60303 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
KIAA0556O60303 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
KIAA0556O60303 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
KIAA0556O60303 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
KIAA0556O60303 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
KIAA0556O60303 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
KIAA0556O60303 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
KIAA0556O60303 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
KIAA0556O60303 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
KIAA0556O60303 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms