Protein–RNA interactions for Protein: O43439

CBFA2T2, Protein CBFA2T2, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFA2T2O43439 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CBFA2T2O43439 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CBFA2T2O43439 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CBFA2T2O43439 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CBFA2T2O43439 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CBFA2T2O43439 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CBFA2T2O43439 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CBFA2T2O43439 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CBFA2T2O43439 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CBFA2T2O43439 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CBFA2T2O43439 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CBFA2T2O43439 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CBFA2T2O43439 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CBFA2T2O43439 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CBFA2T2O43439 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CBFA2T2O43439 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CBFA2T2O43439 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CBFA2T2O43439 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CBFA2T2O43439 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CBFA2T2O43439 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CBFA2T2O43439 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CBFA2T2O43439 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CBFA2T2O43439 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CBFA2T2O43439 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CBFA2T2O43439 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CBFA2T2O43439 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CBFA2T2O43439 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CBFA2T2O43439 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CBFA2T2O43439 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CBFA2T2O43439 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CBFA2T2O43439 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CBFA2T2O43439 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CBFA2T2O43439 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CBFA2T2O43439 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CBFA2T2O43439 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CBFA2T2O43439 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CBFA2T2O43439 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CBFA2T2O43439 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CBFA2T2O43439 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CBFA2T2O43439 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CBFA2T2O43439 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CBFA2T2O43439 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CBFA2T2O43439 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CBFA2T2O43439 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CBFA2T2O43439 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CBFA2T2O43439 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CBFA2T2O43439 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CBFA2T2O43439 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CBFA2T2O43439 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CBFA2T2O43439 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CBFA2T2O43439 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CBFA2T2O43439 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CBFA2T2O43439 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CBFA2T2O43439 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CBFA2T2O43439 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CBFA2T2O43439 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CBFA2T2O43439 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CBFA2T2O43439 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CBFA2T2O43439 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CBFA2T2O43439 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CBFA2T2O43439 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CBFA2T2O43439 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CBFA2T2O43439 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CBFA2T2O43439 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CBFA2T2O43439 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CBFA2T2O43439 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CBFA2T2O43439 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CBFA2T2O43439 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CBFA2T2O43439 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CBFA2T2O43439 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CBFA2T2O43439 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CBFA2T2O43439 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CBFA2T2O43439 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CBFA2T2O43439 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CBFA2T2O43439 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CBFA2T2O43439 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CBFA2T2O43439 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CBFA2T2O43439 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CBFA2T2O43439 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CBFA2T2O43439 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CBFA2T2O43439 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CBFA2T2O43439 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CBFA2T2O43439 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CBFA2T2O43439 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CBFA2T2O43439 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CBFA2T2O43439 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CBFA2T2O43439 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CBFA2T2O43439 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CBFA2T2O43439 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CBFA2T2O43439 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CBFA2T2O43439 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CBFA2T2O43439 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CBFA2T2O43439 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CBFA2T2O43439 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CBFA2T2O43439 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CBFA2T2O43439 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CBFA2T2O43439 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CBFA2T2O43439 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CBFA2T2O43439 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CBFA2T2O43439 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms